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O triptofano é um precursor da niacina (vitamina B3 – vitamina do complexo B) e também um precursor (ingrediente) para produção no organismo do neurotransmissor serotonina e da melatonina.

Uma parte do triptofano pode ser convertida biologicamente em niacina. Cabe ressaltar que a niacina é a única vitamina que tem um aminoácido como seu precursor. A deficiência de niacina é conhecida como pelagra, que é caracterizada por complicações como dermatite, diarreia e demência. Os sinais mais comuns da deficiência de niacina incluem apatia (falta de motivação), perda de memoria, depressão, alterações nas mucosas da língua, estômago, trato intestinal e sistema nervoso. As lesões na pele são comumente observadas em quadros de deficiência dessa vitamina do complexo B.